Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms