Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM140Q9NV12 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM140Q9NV12 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms