Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SH2B1Q9NRF2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms