Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4BQ9NPR2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms