Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRC4Q9NPP4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms