Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDH12Q9NPG4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH12Q9NPG4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms