Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms