Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZCCHC17Q9NP64 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms