Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XAB2Q9HCS7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XAB2Q9HCS7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms