Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRDQ9H2X0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRDQ9H2X0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRDQ9H2X0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRDQ9H2X0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRDQ9H2X0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRDQ9H2X0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms