Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BCL11BQ9C0K0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BCL11BQ9C0K0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCL11BQ9C0K0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms