Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNTNAP4Q9C0A0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTNAP4Q9C0A0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms