Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
SCAPERQ9BY12 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SCAPERQ9BY12 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms