Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SF3B5Q9BWJ5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms