Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIKE1Q9BRV8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms