Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMCHL2Q9BQD1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms