Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlcd1Q99JT6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms