Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85AQ96PX6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms