Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms