Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHACTR3Q96KR7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR3Q96KR7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR3Q96KR7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms