Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BCANQ96GW7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BCANQ96GW7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms