Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACSBG1Q96GR2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACSBG1Q96GR2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSBG1Q96GR2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms