Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC4Q96FT7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms