Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRRFQ96E11 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms