Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC5Q96DU9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms