Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC102AQ96A19 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC102AQ96A19 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC102AQ96A19 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms