Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF34Q969K3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF34Q969K3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms