Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EDEM1Q92611 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms