Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CASKIN1Q8WXD9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CASKIN1Q8WXD9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CASKIN1Q8WXD9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CASKIN1Q8WXD9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms