Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC107Q8WV48 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC107Q8WV48 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms