Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEK9Q8TD19 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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