Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATJQ8NI35 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms