Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38AQ8NAV1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38AQ8NAV1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38AQ8NAV1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF38AQ8NAV1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF38AQ8NAV1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF38AQ8NAV1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms