Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FSIP1Q8NA03 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSIP1Q8NA03 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms