Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG2Q8N3U4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STAG2Q8N3U4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG2Q8N3U4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms