Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms