Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNTD2Q8IXW0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms