Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KSR1Q8IVT5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms