Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS6Q8IU80 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms