Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRX1Q86UT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRX1Q86UT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRX1Q86UT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRX1Q86UT6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRX1Q86UT6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRX1Q86UT6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRX1Q86UT6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRX1Q86UT6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRX1Q86UT6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRX1Q86UT6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRX1Q86UT6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms