Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ZFYVE16Q7Z3T8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZFYVE16Q7Z3T8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZFYVE16Q7Z3T8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms