Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms