Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP9Q7RTR0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms