Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
FGD6Q6ZV73 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
FGD6Q6ZV73 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms