Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRCAPQ6ZRS2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRCAPQ6ZRS2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRCAPQ6ZRS2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms