Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC73Q6ZRK6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC73Q6ZRK6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms