Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN84

CCDC81, Coiled-coil domain-containing protein 81, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC81Q6ZN84 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC81Q6ZN84 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms