Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS1Q6VY07 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS1Q6VY07 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS1Q6VY07 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS1Q6VY07 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS1Q6VY07 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS1Q6VY07 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS1Q6VY07 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PACS1Q6VY07 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PACS1Q6VY07 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PACS1Q6VY07 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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