Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms