Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSSK4Q6SA08 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK4Q6SA08 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms